1. Struktuur ja tööpõhimõte: Gaasikromatograafia-massispektromeetria (GC-MS) on seade, mis lisab gaasikromatograafile massispektromeetria detektori. Gaaskromatograaf kasutab gaasi kandegaasina, soojendab ja aurustab proovi gaasifaasi ning edastab selle mööda kromatograafilist kolonni detektorisse. Gaaskromatograafia-massispektromeetris kasutatakse gaasi ka kandegaasina proovi kuumutamiseks ja aurustamiseks gaasifaasi. Kuid pärast kromatograafiat ioniseeritakse proovimolekulid iooniallikaga, tekitades ioonivoo, mis edastatakse tuvastamiseks massispektromeetria detektorisse. Pärast analüsaatoriga analüüsimist salvestab detektor signaali, et saada teavet proovi koostise kohta. Seetõttu on gaasikromatograafia-massispektromeetrial gaasikromatograafia-massispektromeetria kaks eelist.
2. Tundlikkus ja eraldusvõime: kuna gaasikromatograafi peal on massispektromeetria detektori kiht, on gaasikromatograafia-massispektromeetri tundlikkus ja eraldusvõime kõrgem kui gaasikromatograafia-massispektromeetril. Gaasikromatograafia-massispektromeetria võimaldab analüüsida keerukamaid proove ja tuvastada väga väikese sisaldusega ühendeid.
3. Maksumus: võrreldes gaasikromatograafidega on gaasikromatograafia-massispektromeetrial (GC-MS) täiendav massispektromeetria detektori kiht, seega on selle maksumus samuti kõrgem kui gaasikromatograafial. Sobib olukordades, kus uurimistöös esitatakse kõrgeid nõudeid tuvastamise täpsusele, analüüsi sügavusele ja tundlikkusele.
Kokkuvõtteks võib öelda, et gaasikromatograafia-massispektromeetria (GC-MS) ühendab gaasikromatograafia-massispektromeetria (GC-MS) massispektromeetria detektoriga, mis suudab analüüsida keerukamaid proove suurema tundlikkuse ja eraldusvõimega. See sobib olukordades, kus uurimistöös on nõutav kõrge tuvastamise täpsus, analüüsi sügavus ja tundlikkus, kuid ka maksumus on kõrgem.